ExpressionNormalizationWorkflow

DOI:10.18129 / B9.bioc.ExpressionNormalizationWorkflow

该软件包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见ExpressionNormalizationWorkflow。

基因表达规范化工作流程

Bioconductor版本:3.12

一个广泛的，定制的表达规范化工作流程，包括微阵列的监督规范化(SNM)，代理变量分析(SVA)和主方差成分分析，以识别批效应并从表达数据中删除它们，以增强检测潜在生物信号的能力。

作者:Karthikeyan Murugesan [aut, cre]， Greg Gibson [sad, this]

维护者:Karthikeyan Murugesan

安装

要安装这个包，启动R(版本"4.0")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("ExpressionNormalizationWorkflow")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“ExpressionNormalizationWorkflow”)

超文本标记语言

R脚本

基因表达规范化工作流程

细节

biocViews	GeneExpressionWorkflow，ImmunoOncologyWorkflow，工作流
版本	1.16.0
许可证	GPL (> = 3)
取决于
进口	Biobase(> = 2.24.0),limma(> = 3.20.9),lme4(> = 1.1.7),matrixStats(> = 0.10.3),pvca(> = 1.4.0),球形结构(> = 1.12.0),股东价值分析(> = 3.10.0),vsn(> = 3.32.0)
链接
建议	knitr，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/
这取决于我
进口我
建议我
链接到我

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	ExpressionNormalizationWorkflow_1.16.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/ExpressionNormalizationWorkflow
源存储库(开发人员访问)	git clone git@git.bioconductor.org:packages/ExpressionNormalizationWorkflow
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/ExpressionNormalizationWorkflow/
软件包下载报告	下载数据