该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅注解。
生物导体版本:3.12
注释资源占生物导体项目的很大比例。还有一套可用的在线资源,可以使用特定的软件包访问。本演练将描述这些资源中最受欢迎的资源,并提供一些有关如何使用它们的高级示例。
作者:Marc RJ Carlson [aut],Herve Pages [AUT],Sonali Arora [aut],Valerie Obenchain [aut],Martin Morgan [AUT],Bioconductor Package Wearter [CRE]
维护者:bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>
引用(从r内,输入引用(“注释”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“注释”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“注释”)
html | R脚本 | 注释基因组范围 |
html | R脚本 | 基因组注释资源 |
生物浏览 | 注释工作流,,,,工作流程 |
版本 | 1.14.0 |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | r(> = 3.3.0),变体,,,,AnnotationHub,,,,有机体,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg38.nown,,,,txdb.mmusculus.ucsc.mm10.ensgene,,,,org.hs.eg.db,,,,org.mm.eg.db,,,,同性恋,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19,,,,Biomart,,,,BSGENOME,,,,txdb.Athaliana.biomart.plantsmart22 |
进口 | |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | //www.andersvercelli.com/help/workflows/annotation/annotation_resources/ |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | Annotation_1.14.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
MacOS 10.13(高山脉) | |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/annotation |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/注释 |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/annotation/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |
文档»
生物导体