变体

doi：10.18129/b9.bioc.variants

该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅变体。

注释基因组变体

生物导体版本：3.12

读写VCF文件。确定变体的结构位置，并计算非同义变体的氨基酸编码变化。使用SIFT和Polyphen数据库包来预测氨基酸编码的结果

作者：生物导体软件包维护器[CRE]

维护者：bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ variants”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“变体”）

html

R脚本

注释基因组变体

细节

生物浏览	注释工作流，，，，Immunooncologyworkflow，，，，工作流程
版本	1.13.0
执照	艺术2.0
要看	r（> = 3.3.0），变体，，，，CGDV17，，，，org.hs.eg.db，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg19，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19，，，，polyphen.hsapiens.dbsnp131
进口
链接
建议	尼特，，，，rmarkDown，，，，生物使用
系统要求
增强
URL	//www.andersvercelli.com/help/workflows/variants/
取决于我
进口我
建议我
链接到我

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	variants_1.13.0.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13（高山脉）
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/variants
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/变种
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/variants/
软件包下载报告	下载统计