这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅FindMyFriends。
Bioconductor版本:3.13
框架做微生物比较基因组学在r包的主要目的是协助创建pangenome矩阵来自相关的有机体的基因按相似性分组,以及对这些数据的分析。FindMyFriends提供了许多新方法做pangenome分析和支持一个基因尺度线性分组算法,从而使创造巨大pangenomes可行。
作者:托马斯·彼得森林
维护人员:林托马斯·皮德森< thomasp85 gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“FindMyFriends”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“FindMyFriends”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“FindMyFriends”)
HTML | R脚本 | 创建pangenomes使用FindMyFriends |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 聚类,ComparativeGenomics,DataRepresentation,GenomicVariation,GraphAndNetwork,SequenceMatching,软件 |
版本 | 1.22.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.2 (r - 3.2)(6年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | |
进口 | 方法,BiocGenerics,Biobase、工具、dplyr,IRanges,Biostrings,S4Vectors,烤肉串,igraph,矩阵,消化,filehash,Rcpp,ggplot2,gtable、网格reshape2,ggdendro,BiocParallel跑龙套,统计数据 |
链接 | Rcpp |
建议 | BiocStyle,testthat,knitr,rmarkdown,reutils |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/thomasp85/FindMyFriends |
BugReports | https://github.com/thomasp85/FindMyFriends/issues |
取决于我 | |
进口我 | PanVizGenerator |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
源包 | FindMyFriends_1.22.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS 10.13(高山脉) | FindMyFriends_1.22.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/FindMyFriends |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ FindMyFriends |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/FindMyFriends/ |
包下载报告 | 下载数据 |
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