SwimR

DOI:10.18129 / B9.bioc.SwimR

此包适用于Bioconductor的3.13版本;有关稳定的最新发布版本，请参见SwimR．

一套用于量化秀丽隐杆线虫游泳行为的分析工具

Bioconductor版本:3.13

SwimR是一个基于r的套件，可以计算、分析秀丽隐杆线虫的游泳行为，并绘制其随时间变化的频率。它特别强调识别瘫痪和量化在游泳期间瘫痪的运动元素。数据从一个定制的程序输入到SwipR，该程序适合5点形态测量脊椎，视频中单个蠕虫在一个名为“蠕虫追踪器”的缓冲区中游泳。

作者:Jing Wang < Jing . Wang。2在vanderbilt.edu>， Andrew Hardaway 和Bing Zhang < Bing。张在vanderbilt.edu>

维护者:Randy Blakely

安装

要安装此包，启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“SwimR”)

PDF	R脚本	SwimR
PDF		参考手册

细节

biocViews	软件，可视化
版本	1.29.0
在Bioconductor公司	BioC 2.13 (R-3.0)(8年)
许可证	LGPL-2
取决于	R(>= 3.0.0)，方法，gplots(>= 2.10.1)，热图。加上(>= 1.3)，信号(> = 0.7),R2HTML(> = 2.2.1)
进口	方法
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
给我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	SwimR_1.29.0.tar.gz
Windows二进制	SwimR_1.29.0.zip(32- & 64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	SwimR_1.29.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/SwimR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/SwimR
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/SwimR/
软件包下载报告	下载数据