affyPara

DOI:10.18129 / B9.bioc.affyPara

此包适用于Bioconductor的3.13版本;有关稳定的最新发布版本,请参见affyPara

Affymetrix寡核苷酸阵列并行预处理方法

Bioconductor版本:3.13

该软件包包含用于探索性寡核苷酸阵列分析的并行函数。该软件包是为大量微阵列数据而设计的。

作者:Markus Schmidberger , Esmeralda Vicedo , Ulrich Mansmann < Mansmann at ibe.med.uni-muenchen.de>

维护者:Markus Schmidberger

引用(从R中,输入引用(“affyPara”)):

安装

要安装此包,启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("affyPara")

对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“affyPara”)

PDF R脚本 并行affy函数用于预处理
PDF R脚本 VSN附加项归一化与子样本容量的仿真研究
PDF 参考手册
文本 自述
文本 新闻

细节

biocViews 微阵列预处理软件
版本 1.51.0
Bioconductor自 BioC 2.2 (R-2.7)(13.5年)
许可证 GPL-3
取决于 R(>= 2.5.0),方法,affy(> = 1.20.0),(> = 0.2 3),vsn(> = 3.6.0),aplpack(> = 1.1.1),affyio
进口
链接
建议 affydata
SystemRequirements
增强了 affy
URL http://www.ibe.med.uni-muenchen.de
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包 affyPara_1.51.0.tar.gz
Windows二进制 affyPara_1.51.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) affyPara_1.51.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/affyPara
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ affyPara
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/affyPara/
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