perturbatr

DOI:10.18129 / B9.bioc.perturbatr

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅perturbatr。

统计分析的高通量基因扰动屏幕

Bioconductor版本:3.13

perturbatr级间分析大规模遗传扰动屏幕集成数据集组成的多个屏幕。为多个集成微扰屏幕之间的层次结构模型,该模型考虑了方差不同生理条件下安装。基因影响的结果列表然后进一步扩展使用网络传播算法对假阴性。

作者:西蒙Dirmeier (aut (cre)

维护人员:西蒙Dirmeier <西蒙。在web.de dirmeier >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“perturbatr”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“perturbatr”)

HTML	R脚本	perturbatr食谱
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文本		新闻

细节

biocViews	CellBasedAssays,ImmunoOncology,网络,回归,软件
版本	1.12.0
Bioconductor自	BioC 3.7 (r - 3.5)(3.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R(> = 3.5),方法,统计数据
进口	dplyr,ggplot2,tidyr,为了,lme4样条函数,igraph,foreach平行,doParallel,diffusr,lazyeval,宠物猫、网格跑龙套、图形尺度,magrittr,formula.tools,rlang
链接
建议	testthat,lintr,knitr,rmarkdown,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/cbg-ethz/perturbatr
BugReports	https://github.com/cbg-ethz/perturbatr/issues
取决于我
进口我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	perturbatr_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	perturbatr_1.12.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	perturbatr_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/perturbatr
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ perturbatr
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/perturbatr/
包下载报告	下载数据