王牌

DOI:10.18129 / B9.bioc.ACE

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅王牌。

绝对从信号低拷贝数估计全基因组测序

Bioconductor版本:3.14

使用分段拷贝数的数据来估计肿瘤细胞百分比和生产拷贝数块显示绝对数字副本。

作者:Poell乔斯B

维护人员:乔斯B Poell < j。在amsterdamumc.nl poell >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“王牌”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“王牌”)

HTML	R脚本	ACE装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CopyNumberVariation,报道,DNASeq,测序,软件,可视化,WholeGenome
版本	1.12.0
Bioconductor自	BioC 3.8 (r - 3.5)(3.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.4)
进口	Biobase,QDNAseq,ggplot2、网格数据,跑龙套、方法grDevices,GenomicRanges
链接
建议	knitr,rmarkdown,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/tgac-vumc/ACE
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	ACE_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	ACE_1.12.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	ACE_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ACE
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/王牌
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/ACE/
包下载报告	下载数据