ACME

DOI:10.18129 / B9.bioc.ACME

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见ACME

计算微阵列富集(ACME)算法

Bioconductor版本:3.14

ACME(算法计算微阵列富集)是一套工具,用于分析平片阵列ChIP/ ChIP, DNAse超敏反应,或其他导致基因组区域显示“富集”的实验。它不依赖于特定的阵列技术(尽管阵列应该是一个“平铺”阵列),非常通用(可以应用于导致富集区域的实验),并且对阵列噪声或归一化方法非常不敏感。它的运算速度非常快,在有足够内存的情况下,可以很容易地应用于全基因组平铺阵列实验。

作者:Sean Davis

维护者:Sean Davis

引文(从R内,输入引用(“极致”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“极致”)

PDF R脚本 ACME
PDF 参考手册

细节

biocViews 微阵列,归一化,软件,技术
版本 2.50.0
在Bioconductor BioC 2.0 (R-2.5)(15年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R (>= 2.10),Biobase(>= 2.5.5),方法BiocGenerics
进口 图形、统计数据
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL http://watson.nci.nih.gov/~sdavis
全靠我
进口我
建议我 益生元
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 ACME_2.50.0.tar.gz
Windows二进制 ACME_2.50.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra) ACME_2.50.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ACME
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ACME
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/ACME/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一: