亚当

DOI:10.18129 / B9.bioc.ADAM

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅亚当。

亚当:活动和多样性分析模块

Bioconductor版本:3.14

亚当是一个GSEA R包创建组,一组基因比较样本(控制和实验)根据各自属于不同的物种(基因本体和KEGG通路为默认)和展示他们的意义通过计算假定值引用togene多样性和活动。每组的基因被称为GFAG功能相关的基因(集团)。

作者:安德烈·路易斯Molan (aut),布鲁诺Sanches瑞士[所有],艾格尼丝武田[所有],何塞Rybarczyk球场(cre施,年代)

维护人员:何塞•路易斯Rybarczyk球场<何塞。路易斯在unesp.br >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“亚当”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“亚当”)

HTML	R脚本	用亚当
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细节

biocViews	GeneExpression,GeneSetEnrichment,KEGG,微阵列,通路,软件
版本	1.10.0
Bioconductor自	BioC 3.9 (r - 3.6)(3年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R(> = 3.5),统计,跑龙套,方法
进口	Rcpp(> = 0.12.18),GO.db(> = 3.6.0),KEGGREST(> = 1.20.2),knitr,pbapply(> = 1.3 - 4),dplyr(> = 0.7.6),DT(> = 0.4),stringr(> = 1.3.1),SummarizedExperiment(> = 1.10.1)
链接	Rcpp
建议	testthat,rmarkdown
SystemRequirements	c++ 11
增强了
URL
取决于我	ADAMgui
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	ADAM_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	ADAM_1.10.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13(高山脉)	ADAM_1.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ADAM
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/亚当
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/ADAM/
包下载报告	下载数据