ADAMgui

DOI:10.18129 / B9.bioc.ADAMgui

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本，请参见ADAMgui．

活动和多样性分析模块图形用户界面

Bioconductor版本:3.14

ADAMgui是ADAM包的图形用户界面。ADAMgui包提供了2个基于shine的应用程序，允许用户通过不同的图来研究ADAM包文件的输出。例如，可以选择一个特定的GFAG，并使用GFAGtargetUi函数创建的图观察基因表达行为。利用GFAGpathUi函数绘制的图，可以很容易地看到差异表达、折叠变化等特征。

作者:Giordano Bruno Sanches Seco [aut]， André Luiz Molan [ctb]， Agnes Takeda [ctb]， Jose Rybarczyk Filho [ctb, cre, ths]

维护者:Jose Luiz Rybarczyk Filho < Jose。路易斯在unesp.br>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“ADAMgui”)

超文本标记语言	R脚本	使用ADAMgui
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneSetEnrichment，KEGG，通路，软件
版本	1.10.0
在Bioconductor	BioC 3.9 (R-3.6)(3年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R(>= 3.6)，统计，utils，方法，亚当
进口	GO.db(> = 3.5.0),dplyr(> = 0.7.6),闪亮的(> = 1.1.0版),stringr(> = 1.3.1),stringi(> = 4),varhandle(> = 2.0.3),ggplot2(> = 3.0.0),ggrepel(> = 0.8.0),ggpubr(> = 0.1.8),ggsignif(> = 0.4.0),reshape2(> = 3),RColorBrewer(> = 1.1 2),colorRamps(> = 2.3),DT(> = 0.4),data.table(> = 1.11.4),gridExtra(> = 2.3),shinyjs(> = 1.0),knitr，testthat
链接
建议	减价，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	稍后通知
BugReports	https://github.com/jrybarczyk/ADAMgui/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	ADAMgui_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	ADAMgui_1.10.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	ADAMgui_1.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ADAMgui
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ADAMgui
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/ADAMgui/
软件包下载报告	下载数据