分配

DOI:10.18129 / B9.bioc.ASSIGN

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅分配。

自适应特征选择和集成(分配)

Bioconductor版本:3.14

分配是一个计算工具来评估途径放松管制/激活状态在单独的患者样本。分配了一个灵活的贝叶斯因子分析方法,适应预定路径签名从文学知识或来自扰动实验细胞/组织途径签名。放松管制/每个上下文相关的通路激活水平的量化分数,代表病人样本的程度包括途径放松管制/激活签名。

《图片报》作者:应沈,安德里亚·h·w·埃文约翰逊和Mumtehena拉赫曼

维护者:< yshen3 bu.edu >应慎重,w·埃文约翰逊< wej bu.edu >,大卫·詹金斯dfj bu.edu > < <清楚moomba Mumtehena拉赫曼。拉赫曼在utah.edu >

安装

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如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“转让”)

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文档

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HTML	R脚本	底漆
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	贝叶斯,GeneExpression,通路,软件
版本	1.30.0
Bioconductor自	BioC 2.14 (r - 3.1)(8年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 3.4)
进口	gplots、图形、grDevices二甲基砜,Rlab统计数据,股东价值分析跑龙套,ggplot2,yaml
链接
建议	testthat,BiocStyle,lintr,knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://compbiomed.github.io/ASSIGN/
BugReports	https://github.com/compbiomed/ASSIGN/issues
取决于我
进口我	TBSignatureProfiler
建议我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	ASSIGN_1.30.0.tar.gz
Windows二进制	ASSIGN_1.30.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	ASSIGN_1.30.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ASSIGN
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/分配
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/ASSIGN/
包下载报告	下载数据