ASpediaFI

DOI:10.18129 / B9.bioc.ASpediaFI

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本，请参见ASpediaFI．

ASpedia-FI:可选剪接事件的功能交互分析

Bioconductor版本:3.14

这个包提供了对可选剪接事件及其功能交互进行系统和综合分析的功能。

作者:Doyeong Yu, Kyubin Lee, Daejin Hyung, Soo Young Cho, Charny Park

维护者:Doyeong Yu

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“ASpediaFI”)

PDF	R脚本	ASpediaFI.pdf
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	AlternativeSplicing，注释，报道，GeneExpression，GeneSetEnrichment，GraphAndNetwork，KEGG，网络，NetworkInference，通路，Reactome，测序，软件，转录，可视化
版本	1.8.0
在Bioconductor	BioC 3.10 (R-3.6)(2.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.6.0)，SummarizedExperiment，ROCR
进口	BiocParallel，GenomicAlignments，GenomicFeatures，GenomicRanges，IRanges，iva，Rsamtools，biomaRt，limma，S4Vectors统计数据,DRaWR，GenomeInfoDb，Gviz，矩阵，dplyr，fgsea，reshape2，igraph、图形、e1071、方法、rtracklayer，尺度、网格ggplot2，mGSZ,跑龙套
链接
建议	knitr
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/nachoryu/ASpediaFI
全靠我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	ASpediaFI_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	ASpediaFI_1.8.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	ASpediaFI_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ASpediaFI
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ASpediaFI
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/ASpediaFI/
软件包下载报告	下载数据