AffyRNADegradation

DOI:10.18129 / B9.bioc.AffyRNADegradation

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅AffyRNADegradation。

正确分析和探测位置偏差在微阵列数据由于RNA降解

Bioconductor版本:3.14

包装有助于RNA降解效果的评估和修正Affymetrix 3 '表达阵列。参数d提供一个健壮的和准确测量的RNA的完整性。修正删除探测器位置偏差,从而提高样本的可比性受到RNA降解的影响。

作者:马里奥Fasold

维护人员:马里奥Fasold < Fasold在izbi.uni-leipzig.de >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“AffyRNADegradation”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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PDF	R脚本	AffyRNADegradation例子
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression,微阵列,OneChannel,预处理,质量控制,软件
版本	1.40.0
Bioconductor自	BioC 2.10 (r - 2.15)(10年)
许可证	GPL-2
取决于	R(> = 2.9.0)、方法affy
进口
链接
建议	AmpAffyExample
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	AffyRNADegradation_1.40.0.tar.gz
Windows二进制	AffyRNADegradation_1.40.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	AffyRNADegradation_1.40.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/AffyRNADegradation
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ AffyRNADegradation
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/AffyRNADegradation/
包下载报告	下载数据