此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见AnnotationHubData.
Bioconductor版本:3.14
这些菜谱将各种各样和越来越多的公共生物信息学数据集转换为易于使用的标准Bioconductor数据结构。
作者:Martin Morgan [ctb], Marc Carlson [ctb], Dan Tenenbaum [ctb], Sonali Arora [ctb], Paul Shannon [ctb], Lori Shepherd [ctb], Bioconductor Package Maintainer [cre]
维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>
引文(从R内,输入引用(“AnnotationHubData”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“AnnotationHubData”)
超文本标记语言 | AnnotationHubData简介 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DataImport,软件 |
版本 | 1.24.2 |
在Bioconductor | BioC 3.2 (R-3.2)(6.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R(>= 3.2.2),方法,utils,S4Vectors(> = 0.7.21),IRanges(> = 2.3.23),GenomicRanges,AnnotationHub(> = 2.15.15) |
进口 | GenomicFeatures,Rsamtools,rtracklayer,BiocGenerics,jsonlite,BiocManager,biocViews,BiocCheck,图,AnnotationDbi,Biobase,Biostrings,DBI,GenomeInfoDb(> = 1.15.4),OrganismDbi,RSQLite,AnnotationForge,futile.logger1.3.0(> =版本),XML,RCurl |
链接 | |
建议 | RUnit,knitr,BiocStyle,grasp2db,GenomeInfoDbData,rmarkdown,HubPub |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | ExperimentHubData,ProteomicsAnnotationHubData |
进口我 | AHEnsDbs,EuPathDB |
建议我 | GenomicState,HubPub |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | AnnotationHubData_1.24.2.tar.gz |
Windows二进制 | AnnotationHubData_1.24.2.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | AnnotationHubData_1.24.2.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/AnnotationHubData |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/AnnotationHubData |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/AnnotationHubData/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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