BEclear

DOI:10.18129 / B9.bioc.BEclear

这个包是版本3.14的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本，请参见BEclear。

DNA甲基化数据批次效应的修正

Bioconductor版本:3.14

提供检测和纠正DNA甲基化数据中的批处理效应的功能。核心函数基于潜在因子模型，也可用于预测任何其他包含实数的矩阵中的缺失值。

作者:大卫·拉斯普[作家，作家]， Markus Merl [aut]， Ruslan Akulenko [aut]

维护者:David Rasp < David .j。请登录gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R(版本"4.1")并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" clear")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“BEclear”)

超文本标记语言	R脚本	BEclear教程
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	BatchEffect，DNAMethylation，预处理，软件，StatisticalMethod
版本	2.10.0
在Bioconductor中	BioC 3.1 (R-3.2)(7年)
许可证	GPL-3
取决于	BiocParallel(> = 1.14.2)
进口	futile.logger，Rdpack，矩阵，data.table(> = 1.11.8),Rcpp，离群值，abind，统计，图形，utils，方法
链接	Rcpp
建议	testthat，BiocStyle，knitr，rmarkdown，老鸨
SystemRequirements	c++ 11
增强了
URL	https://github.com/uds-helms/BEclear
BugReports	https://github.com/uds-helms/BEclear/issues
这取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	BEclear_2.10.0.tar.gz
Windows二进制	BEclear_2.10.0.zip(32- & 64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	BEclear_2.10.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/BEclear
源存储库(开发人员访问)	git clone git@git.bioconductor.org:packages/ clear
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/BEclear/
软件包下载报告	下载数据