BioCor

DOI:10.18129 / B9.bioc.BioCor

这个包是版本3.14的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本，请参见BioCor。

功能相似

Bioconductor版本:3.14

计算基于在KEGG和REACTOME或基因集上描述的途径的功能相似性。这些相似性可以计算途径或基因集、基因或集群，并结合其他相似性。它们可以用来改善网络、基因选择、测试关系……

作者:Lluís Revilla Sancho [aut, cre]保罗·桑丘-布鲁[这个]，胡安·何塞·萨尔瓦泰拉·洛萨诺

维护者:Lluís Revilla Sancho <路易斯。Revilla在gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R(版本"4.1")并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("BioCor")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“BioCor”)

超文本标记语言	R脚本	关于BioCor
超文本标记语言	R脚本	BioCor的高级应用
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	聚类，GeneExpression，网络，NetworkEnrichment，通路，软件，StatisticalMethod，SystemsBiology
版本	1.18.0
在Bioconductor中	BioC 3.5 (R-3.4)(5年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R (>= 3.4.0)
进口	BiocParallel，矩阵、方法、GSEABase
链接
建议	reactome.db，org.Hs.eg.db，WGCNA，GOSemSim，testthat，knitr，rmarkdown，BiocStyle，气道，DESeq2，引导，targetscan.Hs.eg.db，Hmisc，拼写
SystemRequirements
增强了
URL	https://llrs.github.io/BioCor/
BugReports	https://github.com/llrs/BioCor/issues
这取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	BioCor_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	BioCor_1.18.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	BioCor_1.18.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/BioCor
源存储库(开发人员访问)	git clone git@git.bioconductor.org:packages/BioCor
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/BioCor/
软件包下载报告	下载数据