此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见BiocSet.
Bioconductor版本:3.14
BiocSet以三重tibble格式显示不同的生物集。这三个tibbles是' element ', ' set '和' elementset '。用户可以激活这三个tibble中的一个,以执行dplyr包中的通用功能。映射功能和访问元素/集的网络引用在bioset中也可用。
作者:Kayla Morrell [aut, cre], Martin Morgan [aut], Kevin Rue-Albrecht [ctb], Lluís Revilla Sancho [ctb]
维护者:Kayla Morrell < Kayla。roswellpark.org>
引文(从R内,输入引用(“BiocSet”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“BiocSet”)
超文本标记语言 | R脚本 | BiocSet:表示Tidyverse中的元素集 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 去,GeneExpression,KEGG,软件 |
版本 | 1.8.1 |
在Bioconductor | BioC 3.10 (R-3.6)(2.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 3.6),dplyr |
进口 | 方法,宠物猫跑龙套,rlang,plyr,S4Vectors,BiocIO,AnnotationDbi,KEGGREST,ontologyIndex,tidyr |
链接 | |
建议 | GSEABase,气道,org.Hs.eg.db,DESeq2,limma,BiocFileCache,GO.db,testthat,knitr,rmarkdown,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | RegEnrich |
进口我 | 麻雀 |
建议我 | dearseq |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | BiocSet_1.8.1.tar.gz |
Windows二进制 | BiocSet_1.8.1.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | BiocSet_1.8.1.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BiocSet |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/BiocSet |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/BiocSet/ |
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