CGHnormaliter

DOI:10.18129 / B9.bioc.CGHnormaliter

这个包是版本3.14的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本,请参见CGHnormaliter

具有不平衡像差的阵列CGH数据的归一化。

Bioconductor版本:3.14

阵列比较基因组杂交(aCGH)数据的规范化和集中化。该算法采用迭代过程,有效地消除了拷贝数不平衡的影响。这导致更可靠的评估拷贝数改变(CNAs)。

作者:Bart P.P. van Houte, Thomas W. Binsl, Hannes Hettling

维护者:Bart P.P. van Houte

引用(来自R,输入引用(“CGHnormaliter”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本"4.1")并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("CGHnormaliter")

对于旧版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:

browseVignettes(“CGHnormaliter”)

PDF R脚本 CGHnormaliter
PDF 参考手册

细节

biocViews 微阵列预处理软件
版本 1.48.0
在Bioconductor中 BioC 2.5 (R-2.10)(12.5年)
许可证 GPL (>= 3)
取决于 CGHcall(> = 2.17.0),CGHbase(> = 1.15.0)
进口 BiobaseCGHbaseCGHcall、方法、统计、utils
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包 CGHnormaliter_1.48.0.tar.gz
Windows二进制 CGHnormaliter_1.48.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) CGHnormaliter_1.48.0.tgz
源库 git clone https://git.bioconductor.org/packages/CGHnormaliter
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/CGHnormaliter
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/CGHnormaliter/
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