类别

DOI:10.18129 / B9.bioc.Category

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见类别

类别分析

Bioconductor版本:3.14

用于执行类别(基因集富集)分析的工具集合。

作者:Robert Gentleman [aut], Seth Falcon [ctb], Deepayan Sarkar [ctb], Robert Castelo [ctb], Bioconductor Package Maintainer [cre]

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

引文(从R内,输入引用(“类别”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“类别”)

PDF R脚本 使用分类分析微阵列数据
PDF R脚本 以染色体带为分类
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 注释,,GeneSetEnrichment,通路,软件
版本 2.60.0
在Bioconductor BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 17年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 方法、stats4BiocGenerics,AnnotationDbi,Biobase,矩阵
进口 跑龙套,统计数据,,RBGL,GSEABase,genefilter,注释,DBI
链接
建议 EBarrays,所有,Rgraphviz,RColorBrewer,xtable(> = 1.4 6),hgu95av2.db,KEGGREST,karyoploteR,geneplotter,limma,晶格,RUnit,org.Sc.sgd.db,GOstats,GO.db
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 GOstats
进口我 categoryCompare,cellHTS2,GmicR,interactiveDisplay,meshr,miRLAB,phenoTest,ppiStats,ReportingTools,scTensor
建议我 GSEAlm,qpgraph,RnBeads
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 Category_2.60.0.tar.gz
Windows二进制 Category_2.60.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) Category_2.60.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Category
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/Category
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/Category/
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