我思

DOI:10.18129 / B9.bioc.Cogito

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本，请参见我思．

比较基因组间隔工具-关于基因组和表观基因组数据集的自动化，完整，可重复和清晰的报告

Bioconductor版本:3.14

生物学研究通常包括多种条件，这些条件通过不同的实验室设置进行检查，如rna测序或芯片测序。为了获得整个结果数据集的概述，Cogito提供了一个关于所有样本和所有不同样本之间的基本比较的自动化、完整、可重复和清晰的报告。该报告可以用作关于数据集的文档，也可以用作进一步自定义分析的起点。

作者:安妮卡Bürger [cre, aut]

维护者:Annika Bürger

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“我思”)

超文本标记语言	R脚本	Cogito:比较注释的基因组间隔工具
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	FunctionalGenomics，GeneRegulation，测序，软件
版本	1.0.0
在Bioconductor	BioC 3.14 (R-4.1)(< 6个月)
许可证	LGPL-3
取决于	R (>= 4.1)，GenomicRanges，jsonlite，GenomicFeatures，熵
进口	BiocManager，rmarkdown，GenomeInfoDb，S4Vectors，AnnotationDbi，图形，统计，utils，方法，magrittr，ggplot2，TxDb.Mmusculus.UCSC.mm9.knownGene
链接
建议	BiocStyle，knitr，减价，testthat(> = 3.0.0)
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	Cogito_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	Cogito_1.0.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	Cogito_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Cogito
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/Cogito
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/Cogito/
软件包下载报告	下载数据