CytoGLMM

DOI:10.18129 / B9.bioc.CytoGLMM

这个包是版本3.14的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本，请参见CytoGLMM．

流式和质量细胞术实验的条件差分分析

Bioconductor版本:3.14

CytoGLMM R包实现了两种多元回归策略:自举广义线性模型(GLM)和广义线性混合模型(GLMM)。大多数当前的数据分析工具比较许多计算发现的细胞类型的表达。CytoGLMM只关注一种细胞类型。由于应用程序的范围较窄，我们可以定义更具体的统计模型，从而更容易控制统计保证。因此，CytoGLMM在流式细胞术和质量细胞术数据中发现差异蛋白，同时减少标记相关性引起的偏差，并防止因患者异质性引起的错误发现。

作者:克里斯托弗·塞勒[aut, cre]

维护者:Christof Seiler < Christof。马斯特里赫特大学的塞勒

安装

要安装这个包，启动R(版本"4.1")并输入:

如果(!require("BiocManager"，悄然= TRUE)) install.packages("BiocManager") biomanager::install("CytoGLMM")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“CytoGLMM”)

超文本标记语言	R脚本	CytoGLMM工作流
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CellBasedAssays，CellBiology，FlowCytometry，ImmunoOncology，蛋白质组学，回归，SingleCell，软件，StatisticalMethod
版本	1.2.0
在Bioconductor中	BioC 3.13 (R-4.1)(1年)
许可证	LGPL-3
取决于
进口	统计数据、方法BiocParallel，RColorBrewer，cowplot，doParallel，dplyr，factoextra，flexmix，ggplot2，magrittr，mb，pheatmap，speedglm，stringr，strucchange，宠物猫，ggrepel，质量，日志记录，矩阵，tidyr，脱字符号，rlang, grDevices
链接
建议	knitr，rmarkdown，testthat，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	https://christofseiler.github.io/CytoGLMMhttps://github.com/ChristofSeiler/CytoGLMM
BugReports	https://github.com/ChristofSeiler/CytoGLMM/issues
这取决于我
进口我	CyTOFpower
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	CytoGLMM_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	CytoGLMM_1.2.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	CytoGLMM_1.2.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/CytoGLMM
源存储库(开发人员访问)	git clone git@git.bioconductor.org:packages/CytoGLMM
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/CytoGLMM/
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