CytoML

DOI:10.18129 / B9.bioc.CytoML

这个包是版本3.14的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本，请参见CytoML。

跨平台细胞仪数据共享的GatingML接口

Bioconductor版本:3.14

使用GatingML2.0标准的平台特定实现与其他软件平台交换门控细胞术数据。

作者:Mike Jiang, Jake Wagner

维护者:Mike Jiang < Mike at ozette.ai>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("CytoML")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“CytoML”)

超文本标记语言	R脚本	flowJo解析器
超文本标记语言	R脚本	如何导出GatingSet到GatingML
超文本标记语言	R脚本	如何将细胞库导入GatingSet
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DataImport，DataRepresentation，FlowCytometry，ImmunoOncology，软件
版本	2.6.0
在Bioconductor	BioC 3.4 (R-3.3)(5.5年)
许可证	文件许可证
取决于	R (>= 3.5.0)
进口	cytolib(> = 2.3.10),flowCore(> = 1.99.10),flowWorkspace(> = 4.1.8),openCyto(> = 1.99.2),XML，data.table，jsonlite，RBGL，Rgraphviz，Biobase、方法、图，图形，实用程序，base64enc，plyr，dplyr设备、方法、ggcyto(> = 1.11.4),yaml，晶格统计数据,corpcor，RUnit，宠物猫，RcppParallel，xml2
链接	Rcpp，黑洞(> = 1.62.0-1),RProtoBufLib，cytolib，Rhdf5lib，RcppArmadillo，RcppParallel(> = 4.4.2-1),flowWorkspace
建议	testthat，flowWorkspaceData，knitr，rmarkdown、并行
SystemRequirements	xml2, GNU make, c++ 11
增强了
URL	https://github.com/RGLab/CytoML
BugReports	https://github.com/RGLab/CytoML/issues
这取决于我
进口我	FlowSOM
建议我	flowWorkspace，openCyto
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	CytoML_2.6.0.tar.gz
Windows二进制	CytoML_2.6.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	CytoML_2.6.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/CytoML
源存储库(开发人员访问)	git clone git@git.bioconductor.org:packages/CytoML
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/CytoML/
软件包下载报告	下载数据