DAPAR

DOI:10.18129 / B9.bioc.DAPAR

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅DAPAR。

工具的微分分析蛋白质丰度与R

Bioconductor版本:3.14

这个包包含一组函数可视化和蛋白质组数据的统计分析。

作者:塞缪尔Wieczorek (aut (cre),佛罗伦萨梳(aut),托马斯•汉堡(aut) Vasile-Cosmin Lazar[所有],Enora Fremy[所有],海琳博尔赫斯(施)

维护人员:塞缪尔Wieczorek <撒母耳。wieczorek在cea.fr >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“DAPAR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

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PDF	R脚本	Prostar用户手册
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文本		新闻

细节

biocViews	DataImport,去,MassSpectrometry,归一化,预处理,蛋白质组学,质量控制,软件
版本	1.26.1
Bioconductor自	BioC 3.2 (r - 3.2)(6.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 4.1.0)
进口	Biobase,MSnbase,宠物猫,RColorBrewer统计数据,preprocessCore,开罗,png,晶格,reshape2,gplots,pcaMethods,ggplot2,limma,knitr,tmvtnorm,规范,嫁祸于,stringrgrDevices图形,openxlsx跑龙套,cp4p(> = 0.3.5),尺度,矩阵,vioplot,imp4p(> = 1.1),forcats、方法、DAPARdata(> = 1.24.0),siggenes,图,lme4,readxl,highcharter,clusterProfiler,dplyr,tidyr,AnnotationDbi,tidyverse,vsn,FactoMineR,factoextra,multcomp,purrr,visNetwork,foreach平行,doParallel,igraph,dendextend,Mfuzz,apcluster,diptest,集群
链接
建议	BiocGenerics,testthat,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.prostar-proteomics.org/
BugReports	https://github.com/samWieczorek/DAPAR/issues
取决于我
进口我	Prostar
建议我	DAPARdata
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	DAPAR_1.26.1.tar.gz
Windows二进制	DAPAR_1.26.1.zip
macOS 10.13(高山脉)	DAPAR_1.26.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DAPAR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ DAPAR
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/DAPAR/
包下载报告	下载数据