这个包是版本3.14的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本,请参见DExMA.
Bioconductor版本:3.14
考虑可能存在的缺失基因,进行基因表达meta分析的所有步骤。它提供了必要的功能,能够执行不同的方法的基因表达荟萃分析。此外,它还包含应用质量控制、下载GEO数据集和显示结果图形表示的功能。
作者:Juan Antonio Villatoro-García [aut, cre], Pedro Carmona-Sáez [aut]
维护者:Juan Antonio Villatoro-García
引用(来自R,输入引用(“DExMA”)
):
要安装这个包,启动R(版本"4.1")并输入:
如果(!require("BiocManager",悄然= TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("DExMA")
对于旧版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:
browseVignettes(“DExMA”)
R脚本 | 用DExMA软件包进行差异表达元分析 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DifferentialExpression,GeneExpression,质量控制,软件,StatisticalMethod |
版本 | 1.2.1 " |
在Bioconductor中 | BioC 3.13 (R-4.1)(1年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (>= 4.1),DExMAdata |
进口 | Biobase,GEOquery,嫁祸于,limma,pheatmap,plyr,尺度,snpStats,股东价值分析,沼泽,统计,方法,utils,bnstruct |
链接 | |
建议 | BiocStyle,qpdf,BiocGenerics,RUnit |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
这取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。
源包 | DExMA_1.2.1.tar.gz |
Windows二进制 | DExMA_1.2.1.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | DExMA_1.2.1.tgz |
源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/DExMA |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/DExMA |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/DExMA/ |
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