DExMA

DOI:10.18129 / B9.bioc.DExMA

这个包是版本3.14的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本,请参见DExMA

差异表达元分析

Bioconductor版本:3.14

考虑可能存在的缺失基因,进行基因表达meta分析的所有步骤。它提供了必要的功能,能够执行不同的方法的基因表达荟萃分析。此外,它还包含应用质量控制、下载GEO数据集和显示结果图形表示的功能。

作者:Juan Antonio Villatoro-García [aut, cre], Pedro Carmona-Sáez [aut]

维护者:Juan Antonio Villatoro-García

引用(来自R,输入引用(“DExMA”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本"4.1")并输入:

如果(!require("BiocManager",悄然= TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("DExMA")

对于旧版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:

browseVignettes(“DExMA”)

PDF R脚本 用DExMA软件包进行差异表达元分析
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文本 新闻

细节

biocViews DifferentialExpressionGeneExpression质量控制软件StatisticalMethod
版本 1.2.1 "
在Bioconductor中 BioC 3.13 (R-4.1)(1年)
许可证 GPL-2
取决于 R (>= 4.1),DExMAdata
进口 BiobaseGEOquery嫁祸于limmapheatmapplyr尺度snpStats股东价值分析沼泽,统计,方法,utils,bnstruct
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建议 BiocStyleqpdfBiocGenericsRUnit
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包档案

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源包 DExMA_1.2.1.tar.gz
Windows二进制 DExMA_1.2.1.zip
macOS 10.13 (High Sierra) DExMA_1.2.1.tgz
源库 git clone https://git.bioconductor.org/packages/DExMA
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/DExMA
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/DExMA/
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