此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见DelayedMatrixStats.
Bioconductor版本:3.14
'matrixStats' API的一个端口,用于使用'DelayedArray'包中的DelayedMatrix对象。在DelayedMatrix对象的行和列上操作的高性能函数,例如col / rowMedians(), col / rowRanks()和col / rowSds()。针对每个数据类型和子集计算优化的函数,从而使内存使用和处理时间最小化。
作者:Peter Hickey [aut, cre], Hervé Pagès [ctb], Aaron Lun [ctb]
维护者:Peter Hickey < Peter。Hickey在gmail.com>
引文(从R内,输入引用(“DelayedMatrixStats”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“DelayedMatrixStats”)
超文本标记语言 | R脚本 | DelayedMatrixStats概述 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | DataRepresentation,基础设施,软件 |
版本 | 1.16.0 |
在Bioconductor | BioC 3.6 (R-3.4)(4.5年) |
许可证 | MIT +文件许可证 |
取决于 | MatrixGenerics(> = 1.5.3)更正,DelayedArray(> = 0.17.6) |
进口 | 方法,matrixStats(> = 0.60.0),sparseMatrixStats,矩阵,S4Vectors(> = 0.17.5),IRanges(> = 2.25.10) |
链接 | |
建议 | testthat,knitr,rmarkdown,covr,BiocStyle,微基准测试,profmem,HDF5Array |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/PeteHaitch/DelayedMatrixStats |
BugReports | https://github.com/PeteHaitch/DelayedMatrixStats/issues |
全靠我 | |
进口我 | 后面;,biscuiteer,bsseq,篮球选手,celldex,Cepo,compartmap,dmrseq,DropletUtils,弗雷泽,glmGamPoi,GSVA,methrix,methylSig,米娅,minfi,mumosa,NxtIRFcore,orthogene,PCAtools,SCArray,嘘,scMerge,食物,天窗,singleCellTK,单,麻雀,weitrix |
建议我 | DelayedArray,MatrixGenerics,mbkmeans,scPCA,弹弓,TrajectoryUtils |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | DelayedMatrixStats_1.16.0.tar.gz |
Windows二进制 | DelayedMatrixStats_1.16.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | DelayedMatrixStats_1.16.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DelayedMatrixStats |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/DelayedMatrixStats |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/DelayedMatrixStats/ |
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