此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见DominoEffect.
Bioconductor版本:3.14
这些功能支持蛋白质热点残基的识别和注释。这些单独的氨基酸以比其周围区域更高的速度积累突变。
作者:Marija Buljan和Peter Blattmann
维护者:Marija Buljan < Marija . Buljan。2 at gmail.com>, Peter Blattmann < Blattmann at imsb.biol.ethz.ch>
引文(从R内,输入引用(“DominoEffect”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“DominoEffect”)
超文本标记语言 | R脚本 | 多米诺效应的小插图包 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 对齐,蛋白质组学,SequenceMatching,软件,SomaticMutation |
版本 | 1.14.0 |
在Bioconductor | BioC 3.7 (R-3.5)(4年) |
许可证 | GPL (>= 3) |
取决于 | R (>= 3.5) |
进口 | biomaRt,data.table, utils,统计,Biostrings,SummarizedExperiment,VariantAnnotation,AnnotationDbi,GenomeInfoDb,IRanges,GenomicRanges、方法 |
链接 | |
建议 | knitr,testthat,rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | DominoEffect_1.14.0.tar.gz |
Windows二进制 | DominoEffect_1.14.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | DominoEffect_1.14.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DominoEffect |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/DominoEffect |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/DominoEffect/ |
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