ExperimentHub

DOI:10.18129 / B9.bioc.ExperimentHub

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见ExperimentHub

客户端访问ExperimentHub资源

Bioconductor版本:3.14

这个包为Bioconductor ExperimentHub网络资源提供了一个客户端。ExperimentHub提供了一个中心位置,可以访问来自实验、出版物或培训课程的策划数据。每个资源都有关联的元数据、标签和修改日期。客户端创建并管理检索到的文件的本地缓存,支持快速和可重复的访问。

作者:Bioconductor Package Maintainer [cre], Martin Morgan [aut], Marc Carlson [ctb], Dan Tenenbaum [ctb], Sonali Arora [ctb], Valerie Oberchain [ctb], Kayla Morrell [ctb], Lori Shepherd [aut]

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

引文(从R内,输入引用(“ExperimentHub”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“ExperimentHub”)

超文本标记语言 R脚本 ExperimentHub:访问ExperimentHub Web服务
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataImportGUI基础设施软件ThirdPartyClient
版本 2.2.1
在Bioconductor BioC 3.4 (R-3.3)(5.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 方法,BiocGenerics(> = 0.15.10),AnnotationHub(> = 2.19.3),BiocFileCache(> = 1.5.1)
进口 跑龙套,S4VectorsBiocManager旋度rappdirs
链接
建议 knitrBiocStylermarkdownHubPub
SystemRequirements
增强了 ExperimentHubData
URL
BugReports https://github.com/Bioconductor/ExperimentHub/issues
全靠我 adductomicsRalpineDataBeadSorted.Saliva.EPICbenchmarkfdrData2019biscuiteerDatabodymapRatbrainImageRdataCellMapperDataclustifyrdatahubcuratedAdipoChIPDMRcatedataewceDataFlowSorted.Blood.EPICFlowSorted.CordBloodCombined.450kHDCytoDataHighlyReplicatedRNASeqHumanAffyDataLRcellmcsurvdataMetaGxBreastMetaGxOvarianMetaGxPancreasmuscDataNanoporeRNASeqNestLinknullrangesDataObMiTirestfulSEDataRNAmodR。数据SCATEDatascpdataSeqSQCsesameDataSimBenchDataspatialDmelxsimSTexampleData鞑靼tcgaWGBSData.hg19TENxVisiumData
进口我 adductDataBioImageDbsBloodGen3ModulecelldexchipseqDBDataCLLmethylationCopyNeutralIMAcuratedMetagenomicDatacuratedTBDatacuratedTCGADatadepmapDMRcateDropletTestFilesDuoClustering2018easierDataemtdataENmixEWCEExperimentHubDataFieldEffectCrcGenomicDistributionsDataGSEABenchmarkeRHarmonizedTCGADataHCADataHMP16SDataHMP2DataimcdatasetsLRcellTypeMarkersm6AboostMACSrmethylclockmethylclockDataMethylSeqDatamicrobiomeDataSetsMouseGastrulationDataMouseThymusAgeingmsigdbNxtIRFdataPhyloProfilePhyloProfileDatapreciseTADhubpwrEWAS.datarestfulSERLHubscRNAseqsignatureSearchsignatureSearchDataSingleCellMultiModalsingleCellTKSingleMoleculeFootprintingDataspatialLIBDTabulaMurisDataTabulaMurisSenisDataTENxBrainDataTENxBUSDataTENxPBMCData肺结核
建议我 曾帮工AnnotationHubbambuBioPlexcelarefcelarefDataCellMappercuratedAdipoArrayDEqMSgenomicInstabilityGSE103322GSE13015GSE159526GSE62944HDF5ArraymetavizrmissMethylMsBackendRawFileReader马斯喀特quantiseqrrawrrrecountmethylationSingleMoleculeFootprintingtissueTreg
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 ExperimentHub_2.2.1.tar.gz
Windows二进制 ExperimentHub_2.2.1.zip
macOS 10.13 (High Sierra) ExperimentHub_2.2.1.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ExperimentHub
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ExperimentHub
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/ExperimentHub/
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