FindMyFriends

DOI:10.18129 / B9.bioc.FindMyFriends

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此包适用于Bioconductor 3.14版。此包已从Bioconductor中删除。有关最新的稳定发布版本，请参见FindMyFriends．

微生物比较基因组学研究

Bioconductor版本:3.14

在r中进行微生物比较基因组学的框架。该软件包的主要目的是协助创建泛基因组矩阵，其中来自相关生物的基因按相似性分组，以及对这些数据的分析。FindMyFriends提供了许多新颖的方法来进行泛基因组分析，并支持线性扩展的基因分组算法，从而使创建巨大的泛基因组变得可行。

作者:Thomas Lin Pedersen

维护者:Thomas Lin Pedersen

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	聚类，ComparativeGenomics，DataRepresentation，GenomicVariation，GraphAndNetwork，SequenceMatching，软件
版本	1.24.0
在Bioconductor	BioC 3.2 (R-3.2)(6.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于
进口	方法,BiocGenerics，Biobase、工具、dplyr，IRanges，Biostrings，S4Vectors，烤肉串，igraph，矩阵，消化，filehash，Rcpp，ggplot2，gtable、网格reshape2，ggdendro，BiocParallel， utils，统计
链接	Rcpp
建议	BiocStyle，testthat，knitr，rmarkdown，reutils
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/thomasp85/FindMyFriends
BugReports	https://github.com/thomasp85/FindMyFriends/issues
全靠我
进口我	PanVizGenerator
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/FindMyFriends
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/FindMyFriends
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/FindMyFriends/
软件包下载报告	下载数据