此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见GA4GHclient.
Bioconductor版本:3.14
GA4GHclient提供了一种通过全球基因组学和健康联盟(GA4GH)基因组学API访问公共数据服务器的简便方法。它提供了对GA4GH API的低级访问,并将响应数据转换为基于bioconductor的类对象。
作者:Welliton Souza [aut, cre], Benilton Carvalho [ctb], Cristiane Rocha [ctb]
维护者:Welliton Souza
引文(从R内,输入引用(“GA4GHclient”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“GA4GHclient”)
超文本标记语言 | R脚本 | GA4GHclient |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DataRepresentation,软件,ThirdPartyClient |
版本 | 1.18.0 |
在Bioconductor | BioC 3.5 (R-3.4)(5年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | S4Vectors |
进口 | BiocGenerics,Biostrings,dplyr,GenomeInfoDb,GenomicRanges,httr,IRanges,jsonlite、方法、VariantAnnotation |
链接 | |
建议 | AnnotationDbi,BiocStyle,DT,knitr,org.Hs.eg.db,rmarkdown,testthat,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/labbcb/GA4GHclient |
BugReports | https://github.com/labbcb/GA4GHclient/issues |
全靠我 | GA4GHshiny |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | GA4GHclient_1.18.0.tar.gz |
Windows二进制 | GA4GHclient_1.18.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | GA4GHclient_1.18.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GA4GHclient |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GA4GHclient |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/GA4GHclient/ |
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