GA4GHclient

DOI:10.18129 / B9.bioc.GA4GHclient

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见GA4GHclient

用于访问GA4GH API数据服务器的Bioconductor包

Bioconductor版本:3.14

GA4GHclient提供了一种通过全球基因组学和健康联盟(GA4GH)基因组学API访问公共数据服务器的简便方法。它提供了对GA4GH API的低级访问,并将响应数据转换为基于bioconductor的类对象。

作者:Welliton Souza [aut, cre], Benilton Carvalho [ctb], Cristiane Rocha [ctb]

维护者:Welliton Souza

引文(从R内,输入引用(“GA4GHclient”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“GA4GHclient”)

超文本标记语言 R脚本 GA4GHclient
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataRepresentation软件ThirdPartyClient
版本 1.18.0
在Bioconductor BioC 3.5 (R-3.4)(5年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 S4Vectors
进口 BiocGenericsBiostringsdplyrGenomeInfoDbGenomicRangeshttrIRangesjsonlite、方法、VariantAnnotation
链接
建议 AnnotationDbiBiocStyleDTknitrorg.Hs.eg.dbrmarkdowntestthatTxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/labbcb/GA4GHclient
BugReports https://github.com/labbcb/GA4GHclient/issues
全靠我 GA4GHshiny
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 GA4GHclient_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 GA4GHclient_1.18.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) GA4GHclient_1.18.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GA4GHclient
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GA4GHclient
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/GA4GHclient/
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