GSReg

DOI:10.18129 / B9.bioc.GSReg

这个包是版本3.14的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本，请参见GSReg．

基因集调控(GS-Reg)

Bioconductor版本:3.14

一个包的基因集分析，基于表达的可变性，以及一种方法来检测备选剪接事件。它实现了差分秩守恒(DIRAC)和基因集表达变异分析(EVA)方法。对于检测差异剪接基因，它提供了一种剪接- eva (SEVA)的实现。

作者:Bahman Afsari < Bahman at jhu.edu>， Elana J. Fertig

维护者:Bahman Afsari < Bahman at jhu.edu>， Elana J. Fertig

安装

要安装这个包，启动R(版本"4.1")并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("GSReg")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“GSReg”)

PDF	R脚本	使用GSReg包
PDF		参考手册

细节

biocViews	AlternativeSplicing，GeneExpression，GeneRegulation，GeneSetEnrichment，GeneticVariability，通路，软件
版本	1.28.0
在Bioconductor中	BioC 3.0 (R-3.1)(7.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 2.13.1);Homo.sapiens，org.Hs.eg.db，GenomicFeatures，AnnotationDbi
进口
链接
建议	GenomicRanges，GSBenchMark
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	GSReg_1.28.0.tar.gz
Windows二进制	GSReg_1.28.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	GSReg_1.28.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/GSReg
源存储库(开发人员访问)	git clone git@git.bioconductor.org:packages/GSReg
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/GSReg/
软件包下载报告	下载数据