GladiaTOX

DOI:10.18129 / B9.bioc.GladiaTOX

这个包是版本3.14的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本，请参见GladiaTOX。

R包处理高内容筛选数据

Bioconductor版本:3.14

GladiaTOX R包是一个开源的，灵活的解决方案，用于生物医学研究中的高内容筛选数据处理和报告。GladiaTOX利用了tcpl的核心功能，并提供了许多扩展:它提供了一个web服务解决方案来获取原始数据;它计算严重性分数并输出ToxPi格式的文件;此外，它还包含一套生成PDF报告的功能，用于质量控制和数据处理。

作者:Vincenzo Belcastro [aut, cre]， Dayne L Filer [aut]， Stephane Cano [aut]

维护:PMP S.A. R Support

安装

要安装这个包，启动R(版本"4.1")并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("GladiaTOX")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“GladiaTOX”)

超文本标记语言	R脚本	GladiaTOX
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	归一化，预处理，质量控制，软件，WorkflowStep
版本	1.10.3
在Bioconductor中	BioC 3.9 (R-3.6)(3年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 3.6.0)，data.table(> = 1.9.4)
进口	DBI，RMySQL，RSQLite，numDeriv，RColorBrewer、并行、统计、方法、图形、grDevices、xtable、工具、酿造，stringr，RJSONIO，ggplot2，ggrepel，tidyr跑龙套,RCurl，XML
链接
建议	roxygen2，knitr，rmarkdown，testthat，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	GladiaTOX_1.10.3.tar.gz
Windows二进制	GladiaTOX_1.10.3.zip(32- & 64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	GladiaTOX_1.10.3.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/GladiaTOX
源存储库(开发人员访问)	git clone git@git.bioconductor.org:packages/GladiaTOX
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/GladiaTOX/
软件包下载报告	下载数据