GmicR

DOI:10.18129 / B9.bioc.GmicR

这个包是版本3.14的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本，请参见GmicR．

结合WGCNA和xCell读数与贝叶斯网络学习生成基因模块免疫细胞网络(GMIC)

Bioconductor版本:3.14

该包使用贝叶斯网络学习来检测WGCNA检测到的基因模块与xCell定义的免疫细胞特征之间的关系。它是一个假设生成工具。

作者:Richard Virgen-Slane

维护者:Richard Virgen-Slane

安装

要安装这个包，启动R(版本"4.1")并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("GmicR")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“GmicR”)

超文本标记语言	R脚本	GmicR_vignette
PDF		参考手册
文本		许可证

细节

biocViews	贝叶斯，聚类，GUI，GeneExpression，GraphAndNetwork，ImmunoOncology，网络，NetworkInference，质量控制，软件，SystemsBiology
版本	1.8.0
在Bioconductor中	BioC 3.10 (R-3.6)(2.5年)
许可证	GPL-2 +文件许可证
取决于
进口	AnnotationDbi，猿，bnlearn，类别，DT，doParallel，foreach，gRbase，GSEABase，粮食，GOstats，org.Hs.eg.db，org.Mm.eg.db，闪亮的，WGCNA，data.table、grDevices、图形、reshape2，统计，utils
链接
建议	knitr，rmarkdown，testthat
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	GmicR_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	GmicR_1.8.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	GmicR_1.8.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/GmicR
源存储库(开发人员访问)	git clone git@git.bioconductor.org:packages/GmicR
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/GmicR/
软件包下载报告	下载数据