此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见HTSFilter.
Bioconductor版本:3.14
该包实现了基于全球Jaccard相似指数的复制转录组测序数据的过滤程序,以便在一个或多个实验条件下识别低表达水平恒定的基因。
作者:Andrea Rau [cre, aut],梅丽娜·加洛平[ctb],吉勒斯·塞吕[ctb],弗洛伦斯Jaffrézic [ctb]
维护者:Andrea Rau < Andrea。Rau在inrae.fr>
引文(从R内,输入引用(“HTSFilter”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“HTSFilter”)
超文本标记语言 | R脚本 | HTSFilter |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DifferentialExpression,GeneExpression,ImmunoOncology,归一化,预处理,RNASeq,测序,软件 |
版本 | 1.34.0 |
在Bioconductor | BioC 2.12 (R-3.0)(9年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 4.0.0) |
进口 | 刨边机,DESeq2,BiocParallel,Biobase, utils,统计,grDevices,图形,方法 |
链接 | |
建议 | EDASeq,testthat,knitr,rmarkdown,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | coseq |
建议我 | HTSCluster |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | HTSFilter_1.34.0.tar.gz |
Windows二进制 | HTSFilter_1.34.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | HTSFilter_1.34.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HTSFilter |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/HTSFilter |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/HTSFilter/ |
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