检查

DOI:10.18129 / B9.bioc.INSPEcT

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本，请参见检查。

利用RNA-seq数据建模RNA合成、处理和降解

Bioconductor版本:3.14

INSPEcT(从转录组数据中推断合成、处理和降解率)RNA-seq数据在时间过程实验或稳态条件下，有或没有新生RNA数据的支持。

作者:Stefano de Pretis

维护人员:Stefano de Pretis ， Mattia Furlan

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“检查”)

超文本标记语言	R脚本	从转录组数据推断合成、处理和降解率
超文本标记语言	R脚本	INSPEcT_GUI.html
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneRegulation，RNASeq，测序，软件，SystemsBiology，TimeCourse
版本	1.24.0
在Bioconductor	BioC 3.2 (R-3.2)(6.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R(>= 3.6)，方法，Biobase，BiocParallel
进口	pROC，deSolve，rootSolve，KernSmooth，gdata，GenomicFeatures，GenomicRanges，IRanges，BiocGenerics，GenomicAlignments，Rsamtools，S4Vectors，GenomeInfoDb，DESeq2，plgem，rtracklayer，SummarizedExperiment，TxDb.Mmusculus.UCSC.mm9.knownGene，闪亮的
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	INSPEcT_1.24.0.tar.gz
Windows二进制	INSPEcT_1.24.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	INSPEcT_1.24.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/INSPEcT
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/INSPEcT
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/INSPEcT/
软件包下载报告	下载数据