萝拉

DOI:10.18129 / B9.bioc.LOLA

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅萝拉。

轨迹重叠分析基因组范围的浓缩

Bioconductor版本:3.14

提供功能测试集重叠的基因组区域与公众和自定义区域设置(基因组范围)数据库。这个可以做自动浓缩分析基因组区域集,从而促进的解释功能基因组和表观基因组学数据。

作者:内森谢菲尔德< http://www.databio.org > (aut (cre) Christoph烈性黑啤酒(施)

维修工:内森谢菲尔德内森< code.databio.org >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“洛拉”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“洛拉”)

HTML	R脚本	1。开始使用它
HTML	R脚本	2。使用洛拉核心
HTML	R脚本	3所示。选择一个宇宙
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ChIPSeq,FunctionalGenomics,GeneRegulation,GeneSetEnrichment,GenomeAnnotation,MethylSeq,测序,软件,SystemsBiology
版本	1.24.0
Bioconductor自	BioC 3.2 (r - 3.2)(6.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 2.10)
进口	BiocGenerics,S4Vectors,IRanges,GenomicRanges,data.table,reshape2跑龙套,统计方法
链接
建议	平行,testthat,knitr,BiocStyle,rmarkdown
SystemRequirements
增强了	simpleCache,qvalue,ggplot2
URL	http://code.databio.org/LOLA
BugReports	http://github.com/nsheff/LOLA
取决于我
进口我
建议我	可可,位深蓝,MAGAR,米拉,ramr
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	LOLA_1.24.0.tar.gz
Windows二进制	LOLA_1.24.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	LOLA_1.24.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/LOLA
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/洛拉
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/LOLA/
包下载报告	下载数据