中长期规划

DOI:10.18129 / B9.bioc.MLP

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见中长期规划

平均对数P分析

Bioconductor版本:3.14

途径分析基于p值相关的基因从感兴趣的基因表达分析。实用函数能够从基因本体论生物过程(GOBP)、分子函数(GOMF)和细胞成分(GOCC)、京都基因组基因百科全书(KEGG)和反应组数据库中提取途径。方法和辅助功能,显示结果为表格,路径显著性barplot,基因本体图和路径显著性。

作者:Nandini Raghavan [aut], Tobias Verbeke [aut], An De Bondt [aut], Javier Cabrera [ctb], Dhammika Amaratunga [ctb], Tine Casneuf [ctb], Willem Ligtenberg [ctb], Laure Cougnaud [cre]

维护者:Tobias Verbeke < Tobias。Verbeke在openanalysis .eu>

引文(从R内,输入引用(“延时”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“延时”)

PDF R脚本 UsingMLP
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews GeneExpression遗传学KEGG通路Reactome软件
版本 1.42.0
在Bioconductor BioC 2.8 (R-2.13)(11年)
许可证 GPL-3
取决于
进口 AnnotationDbigplots,图形,统计,效用
链接
建议 GO.dborg.Hs.eg.dborg.Mm.eg.dborg.Rn.eg.dborg.Cf.eg.dbKEGGREST注释RgraphvizGOstatslimmamouse4302.dbreactome.db
SystemRequirements
增强了
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建议我 a4
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 MLP_1.42.0.tar.gz
Windows二进制 MLP_1.42.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra) MLP_1.42.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MLP
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MLP
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/MLP/
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