此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见中长期规划.
Bioconductor版本:3.14
途径分析基于p值相关的基因从感兴趣的基因表达分析。实用函数能够从基因本体论生物过程(GOBP)、分子函数(GOMF)和细胞成分(GOCC)、京都基因组基因百科全书(KEGG)和反应组数据库中提取途径。方法和辅助功能,显示结果为表格,路径显著性barplot,基因本体图和路径显著性。
作者:Nandini Raghavan [aut], Tobias Verbeke [aut], An De Bondt [aut], Javier Cabrera [ctb], Dhammika Amaratunga [ctb], Tine Casneuf [ctb], Willem Ligtenberg [ctb], Laure Cougnaud [cre]
维护者:Tobias Verbeke < Tobias。Verbeke在openanalysis .eu>
引文(从R内,输入引用(“延时”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“延时”)
R脚本 | UsingMLP | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 去,GeneExpression,遗传学,KEGG,通路,Reactome,软件 |
版本 | 1.42.0 |
在Bioconductor | BioC 2.8 (R-2.13)(11年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | |
进口 | AnnotationDbi,gplots,图形,统计,效用 |
链接 | |
建议 | GO.db,org.Hs.eg.db,org.Mm.eg.db,org.Rn.eg.db,org.Cf.eg.db,KEGGREST,注释,Rgraphviz,GOstats,图,limma,mouse4302.db,reactome.db |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | esetVis |
建议我 | a4 |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | MLP_1.42.0.tar.gz |
Windows二进制 | MLP_1.42.0.zip(32位和64位) |
macOS 10.13 (High Sierra) | MLP_1.42.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MLP |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MLP |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/MLP/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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