MMUPHin

DOI:10.18129 / B9.bioc.MMUPHin

这个包是版本3.14的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本，请参见MMUPHin．

微生物组研究异质性的统一管道荟萃分析方法

Bioconductor版本:3.14

MMUPHin是一个R软件包，用于微生物组队列的荟萃分析任务。它具有以下功能接口:a)协变量控制的批和队列效应调整，b)元分析差分丰度检验，c)元分析无监督离散结构(聚类)发现，d)元分析无监督连续结构发现。

作者:马思源

维护者:马思源<符号。研究在gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R(版本"4.1")并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("MMUPHin")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“MMUPHin”)

超文本标记语言	R脚本	MMUPHin
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	BatchEffect，宏基因组，微生物组，软件
版本	1.8.2
在Bioconductor中	BioC 3.10 (R-3.6)(2.5年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R (>= 3.6)
进口	Maaslin2，metafor，fpc，igraph，ggplot2，dplyr，tidyr，cowplot， utils, stats, grDevices
链接
建议	testthat，BiocStyle，knitr，rmarkdown，magrittr，素食主义者，phyloseq，curatedMetagenomicData，genefilter
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	MMUPHin_1.8.2.tar.gz
Windows二进制	MMUPHin_1.8.2.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	MMUPHin_1.8.1.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/MMUPHin
源存储库(开发人员访问)	git clone git@git.bioconductor.org:packages/MMUPHin
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/MMUPHin/
软件包下载报告	下载数据