这个包是弃用.它可能会从Bioconductor中移除。详情请参阅包临终的指导方针为更多的信息。
此包适用于Bioconductor的3.14版本。此包已从Bioconductor中删除。有关最新的稳定发布版本,请参见MSGFgui.
Bioconductor版本:3.14
这个包使得在GUI环境中使用MSGFplus包执行分析成为可能。此外,它还允许用户使用交互图、汇总统计和过滤来调查结果。最后,它将当前结果公开给另一个R会话,以便用户可以无缝地将gui集成到其他工作流中。
作者:Thomas Lin Pedersen
维护人员:Thomas Lin Pedersen
引用(从R中,输入引用(“MSGFgui”)
):
要安装此包,启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“MSGFgui”)
超文本标记语言 | R脚本 | 使用MSGFgui |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | GUI,ImmunoOncology,MassSpectrometry,蛋白质组学,软件,可视化 |
版本 | 1.28.0 |
Bioconductor自 | bio 3.0 (R-3.1)(7.5年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | mzR,xlsx |
进口 | 闪亮的,mzID(> = 1.2),MSGFplus,shinyFiles(> = 0.4.0)、工具 |
链接 | |
建议 | knitr,testthat |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | MSGFgui_1.28.0.tar.gz |
Windows二进制 | MSGFgui_1.28.0.zip(32位和64位) |
macOS 10.13 (High Sierra) | MSGFgui_1.28.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MSGFgui |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MSGFgui |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/MSGFgui/ |
包下载报告 | 下载数据 |
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Bioconductor
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