MSGFplus

DOI:10.18129 / B9.bioc.MSGFplus

这个包是弃用．它可能会从Bioconductor中移除。详情请参阅包临终的指导方针为更多的信息。

此包适用于Bioconductor的3.14版本。此包已从Bioconductor中删除。有关最新的稳定发布版本，请参见MSGFplus．

R与MS-GF+的接口

Bioconductor版本:3.14

该软件包包含使用MS-GF+算法进行肽段识别的功能。该包包含用代码和通过简单GUI构建参数集的功能，以及批量运行算法(可能是异步的)的功能。

作者:Thomas Lin Pedersen

维护人员:Thomas Lin Pedersen

安装

要安装此包，启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“MSGFplus”)

超文本标记语言	R脚本	使用MSGFgui
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ImmunoOncology，MassSpectrometry，蛋白质组学，软件
版本	1.28.0
Bioconductor自	bio 3.0 (R-3.1)(7.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	方法
进口	mzID，ProtGenerics
链接
建议	knitr，testthat
SystemRequirements	Java (> = 1.7)
增强了
URL
取决于我
进口我	MSGFgui
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	MSGFplus_1.28.0.tar.gz
Windows二进制	MSGFplus_1.28.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	MSGFplus_1.28.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MSGFplus
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MSGFplus
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/MSGFplus/
包下载报告	下载数据