MSPrep

DOI:10.18129 / B9.bioc.MSPrep

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅MSPrep。

计划总结、过滤、改动和正常化代谢组学数据

Bioconductor版本:3.14

包执行总结复制、过滤频率,几种不同的选项,将缺失的数据,和转换的多种选择,批量纠正和规范数据。

作者:马克斯·麦格拉思(aut (cre),马特Mulvahill (aut),格兰特休斯(aut),肖恩·雅各布森(aut),哈里森Pielke-lombardo (aut) (Katerina Kechris (aut cph,年代)

维修工:马克斯·麦格拉思<马克斯。麦格拉思ucdenver.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“MSPrep”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“MSPrep”)

HTML	R脚本	使用MSPrep
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细节

biocViews	MassSpectrometry,代谢组学,预处理,软件
版本	1.4.0
Bioconductor自	BioC 3.12 (r - 4.0)(1.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 4.0)
进口	SummarizedExperiment,S4Vectors,pcaMethods(> = 1.24.0),VIM,crmn,preprocessCore,股东价值分析,dplyr(> = 0.7),tidyr,宠物猫(> = 1.2),magrittr,rlang统计数据,stringr、方法、ddpcr,missForest
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown,testthat(> = 1.0.2中)
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/KechrisLab/MSPrep
BugReports	https://github.com/KechrisLab/MSPrep/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	MSPrep_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	MSPrep_1.4.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	MSPrep_1.4.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MSPrep
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MSPrep
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/MSPrep/
包下载报告	下载数据