MSstatsPTM

DOI:10.18129 / B9.bioc.MSstatsPTM

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本，请参见MSstatsPTM．

翻译后修饰的统计学表征

Bioconductor版本:3.14

MSstatsPTM为定量描述翻译后修饰(PTMs)提供了一般的统计方法。支持DDA、DIA、TMT (tandem mass tag)标签。通常，分析涉及PTM位点(即修饰残基)及其对应蛋白的定量，以及定量结果的整合。MSstatsPTM提供了在实验条件下总结、估计PTM位点丰度和检测PTM变化的功能。

作者:Devon Kohler [aut, cre]，蔡宗衡[aut]，黄婷[aut]， Mateusz Staniak [aut]， Meena Choi [aut]， Olga Vitek [aut]

维护者:德文·科勒<科勒。D在northeastern。edu>

安装

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如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("MSstatsPTM")

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文档

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browseVignettes(“MSstatsPTM”)

超文本标记语言	R脚本	MSstatsPTM LabelFree工作流
超文本标记语言	R脚本	MSstatsPTM TMT工作流程
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression，ImmunoOncology，MassSpectrometry，归一化，OneChannel，蛋白质组学，质量控制，软件，TwoChannel
版本	1.4.2
在Bioconductor	BioC 3.12 (R-4.0)(1.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 4.0)
进口	dplyr，gridExtra，stringr统计数据,ggplot2grDevices,MSstatsTMT，MSstatsConvert，MSstats，data.table，Rcpp，Biostrings，使彻底失败，ggrepel
链接	Rcpp
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，tinytest，covr
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/Vitek-Lab/MSstatsPTM/issues
全靠我
进口我	MSstatsLiP
建议我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	MSstatsPTM_1.4.2.tar.gz
Windows二进制	MSstatsPTM_1.4.2.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	MSstatsPTM_1.4.2.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MSstatsPTM
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MSstatsPTM
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/MSstatsPTM/
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