MsBackendMgf

DOI:10.18129 / B9.bioc.MsBackendMgf

这个包是版本3.14的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本,请参见MsBackendMgf

Mascot通用格式(mgf)文件的质谱数据后端

Bioconductor版本:3.14

质谱(MS)数据后端支持从Mascot通用格式(mgf)文件导入和导出MS/MS光谱数据。在此包中定义的对象应该与Spectra Bioconductor包一起使用。因此,这个包将mgf文件支持添加到Spectra包中。

作者:RforMassSpectrometry Package维护者[cre], Laurent Gatto [aut],约翰内斯·莱纳[奥特]——塞巴斯蒂安·吉布

维护人员:rformassspectrometry.org维护人员

引用(来自R,输入引用(“MsBackendMgf”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本"4.1")并输入:

如果(!require("BiocManager",悄然= TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("MsBackendMgf")

对于旧版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:

browseVignettes(“MsBackendMgf”)

超文本标记语言 R脚本 MsBackendMgf的描述和用法
PDF 参考手册

细节

biocViews DataImport基础设施MassSpectrometry代谢组学蛋白质组学软件
版本 1.2.0
在Bioconductor中 BioC 3.13 (R-4.1)(1年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 4.0),光谱(> = 1.0)
进口 BiocParallelS4VectorsIRangesMsCoreUtils,方法,统计
链接
建议 testthatknitr(> = 1.1.0版),roxygen2BiocStyle(> = 2.5.19),rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/RforMassSpectrometry/MsBackendMgf
BugReports https://github.com/RforMassSpectrometry/MsBackendMgf/issues
这取决于我
进口我
建议我 xcms
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包 MsBackendMgf_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 MsBackendMgf_1.2.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) MsBackendMgf_1.2.0.tgz
源库 git clone https://git.bioconductor.org/packages/MsBackendMgf
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/MsBackendMgf
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/MsBackendMgf/
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