MsCoreUtils

DOI:10.18129 / B9.bioc.MsCoreUtils

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见MsCoreUtils

质谱数据的核心Utils

Bioconductor版本:3.14

MsCoreUtils定义了用于质谱数据的低级函数,并且独立于任何高级数据结构。这些函数包括质谱处理函数(噪声估计,平滑,分节),定量聚合函数(中位数优化,稳健摘要,…),缺失数据imputation,数据归一化(分位数,vsn,…)以及misc辅助函数,这些函数在R for质谱包中的高级数据结构中使用。

作者:rformassspectra Package Maintainer [cre], Laurent Gatto [aut],约翰·雷纳[au],塞巴斯蒂安·吉布[au],阿德里安·斯蒂格[ctb],西格杜尔·斯马森[ctb],托马斯·纳克[ctb],何塞普·玛丽亚·巴迪亚·阿帕里西奥[ctb],迈克尔·威廷[ctb]

维护者:rformassspectrometry.org的rformassspectrometry.org维护者<维护者

引文(从R内,输入引用(“MsCoreUtils”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“MsCoreUtils”)

超文本标记语言 R脚本 质谱数据的核心Utils
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 基础设施MassSpectrometry代谢组学蛋白质组学软件
版本 1.6.2
在Bioconductor BioC 3.11 (R-4.0)(2年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 3.6.0)
进口 方法,S4Vectors质量统计数据,线索
链接 Rcpp
建议 testthatknitrBiocStylermarkdownroxygen2imputeLCMD嫁祸于规范pcaMethodsvsnpreprocessCore
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/RforMassSpectrometry/MsCoreUtils
BugReports https://github.com/RforMassSpectrometry/MsCoreUtils/issues
全靠我
进口我 MetaboCoreUtilsMsBackendMassbankMsBackendMgfMsBackendRawFileReaderMsFeaturesMSnbaseQFeaturesscp光谱xcms
建议我 msqrob2
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 MsCoreUtils_1.6.2.tar.gz
Windows二进制 MsCoreUtils_1.6.2.zip
macOS 10.13 (High Sierra) MsCoreUtils_1.6.2.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MsCoreUtils
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MsCoreUtils
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/MsCoreUtils/
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