此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见MsCoreUtils.
Bioconductor版本:3.14
MsCoreUtils定义了用于质谱数据的低级函数,并且独立于任何高级数据结构。这些函数包括质谱处理函数(噪声估计,平滑,分节),定量聚合函数(中位数优化,稳健摘要,…),缺失数据imputation,数据归一化(分位数,vsn,…)以及misc辅助函数,这些函数在R for质谱包中的高级数据结构中使用。
作者:rformassspectra Package Maintainer [cre], Laurent Gatto [aut],约翰·雷纳[au],塞巴斯蒂安·吉布[au],阿德里安·斯蒂格[ctb],西格杜尔·斯马森[ctb],托马斯·纳克[ctb],何塞普·玛丽亚·巴迪亚·阿帕里西奥[ctb],迈克尔·威廷[ctb]
维护者:rformassspectrometry.org的rformassspectrometry.org维护者<维护者
引文(从R内,输入引用(“MsCoreUtils”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“MsCoreUtils”)
超文本标记语言 | R脚本 | 质谱数据的核心Utils |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 基础设施,MassSpectrometry,代谢组学,蛋白质组学,软件 |
版本 | 1.6.2 |
在Bioconductor | BioC 3.11 (R-4.0)(2年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 3.6.0) |
进口 | 方法,S4Vectors,质量统计数据,线索 |
链接 | Rcpp |
建议 | testthat,knitr,BiocStyle,rmarkdown,roxygen2,imputeLCMD,嫁祸于,规范,pcaMethods,vsn,preprocessCore |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/RforMassSpectrometry/MsCoreUtils |
BugReports | https://github.com/RforMassSpectrometry/MsCoreUtils/issues |
全靠我 | |
进口我 | MetaboCoreUtils,MsBackendMassbank,MsBackendMgf,MsBackendRawFileReader,MsFeatures,MSnbase,QFeatures,scp,光谱,xcms |
建议我 | msqrob2 |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | MsCoreUtils_1.6.2.tar.gz |
Windows二进制 | MsCoreUtils_1.6.2.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | MsCoreUtils_1.6.2.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MsCoreUtils |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MsCoreUtils |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/MsCoreUtils/ |
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