NanoStringNCTools

DOI:10.18129 / B9.bioc.NanoStringNCTools

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见NanoStringNCTools

NanoString nCounter工具

Bioconductor版本:3.14

纳米串技术工具nCounter技术。提供将RCC文件读入ExpressionSet派生对象的支持。还包括方法的质量控制和标准化的纳米串数据。

作者:Patrick Aboyoun [aut], Nicole Ortogero [cre], zhiyang [ctb]

维护者:Nicole Ortogero

引文(从R内,输入引用(“NanoStringNCTools”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“NanoStringNCTools”)

超文本标记语言 R脚本 介绍nanostringccset类
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文本 许可证

细节

biocViews CellBasedAssaysDataImportGeneExpressionProprietaryPlatforms蛋白质组学RNASeq软件转录转录组mRNAMicroarray
版本 1.2.0
在Bioconductor BioC 3.13 (R-4.1)(1年)
许可证 麻省理工学院
取决于 R (>= 3.6),BiobaseS4Vectorsggplot2
进口 BiocGenericsBiostringsggbeeswarmggiraphggthemesgrDevices,IRanges、方法、pheatmapRColorBrewer,统计,效用
链接
建议 biovizBaseggbioRUnitrmarkdownknitrqpdf
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 GeomxToolsGeoMxWorkflows
进口我 GeoDiff
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 NanoStringNCTools_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 NanoStringNCTools_1.2.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) NanoStringNCTools_1.2.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/NanoStringNCTools
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/NanoStringNCTools
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/NanoStringNCTools/
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