此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见NanoStringNCTools.
Bioconductor版本:3.14
纳米串技术工具nCounter技术。提供将RCC文件读入ExpressionSet派生对象的支持。还包括方法的质量控制和标准化的纳米串数据。
作者:Patrick Aboyoun [aut], Nicole Ortogero [cre], zhiyang [ctb]
维护者:Nicole Ortogero
引文(从R内,输入引用(“NanoStringNCTools”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“NanoStringNCTools”)
超文本标记语言 | R脚本 | 介绍nanostringccset类 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | CellBasedAssays,DataImport,GeneExpression,ProprietaryPlatforms,蛋白质组学,RNASeq,软件,转录,转录组,mRNAMicroarray |
版本 | 1.2.0 |
在Bioconductor | BioC 3.13 (R-4.1)(1年) |
许可证 | 麻省理工学院 |
取决于 | R (>= 3.6),Biobase,S4Vectors,ggplot2 |
进口 | BiocGenerics,Biostrings,ggbeeswarm,ggiraph,ggthemesgrDevices,IRanges、方法、pheatmap,RColorBrewer,统计,效用 |
链接 | |
建议 | biovizBase,ggbio,RUnit,rmarkdown,knitr,qpdf |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | GeomxTools,GeoMxWorkflows |
进口我 | GeoDiff |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | NanoStringNCTools_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | NanoStringNCTools_1.2.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | NanoStringNCTools_1.2.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/NanoStringNCTools |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/NanoStringNCTools |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/NanoStringNCTools/ |
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