此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见QFeatures.
Bioconductor版本:3.14
QFeatures基础设施能够管理和处理高通量质谱分析的定量特征。它提供了熟悉的Bioconductor用户体验,以连贯和易于处理的格式管理不同检测水平(如肽谱匹配,肽和蛋白质)的定量数据。
作者:Laurent Gatto [aut, cre]——克里斯托夫·凡达
维护者:Laurent Gatto < Laurent。Gatto at uclouvain.be>
引文(从R内,输入引用(“QFeatures”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“QFeatures”)
超文本标记语言 | R脚本 | 来自QFeatures对象的数据可视化 |
超文本标记语言 | R脚本 | 用QFeatures处理定量蛋白质组学数据 |
超文本标记语言 | R脚本 | 质谱数据的定量特征 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 基础设施,MassSpectrometry,代谢组学,蛋白质组学,软件 |
版本 | 1.4.0 |
在Bioconductor | BioC 3.12 (R-4.0)(1.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 4.0),MultiAssayExperiment |
进口 | 方法,统计,效用,S4Vectors,IRanges,SummarizedExperiment,BiocGenerics,ProtGenerics(> = 1.19.3),AnnotationFilter,lazyeval,Biobase,MsCoreUtils(> = 1.1.2),igraph,情节 |
链接 | |
建议 | SingleCellExperiment,HDF5Array,msdata,ggplot2,gplots,dplyr,limma,magrittr,DT,闪亮的,shinydashboard,testthat,knitr,BiocStyle,rmarkdown,vsn,preprocessCore,matrixStats,imputeLCMD,pcaMethods,嫁祸于,规范,ComplexHeatmap |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/RforMassSpectrometry/QFeatures |
BugReports | https://github.com/RforMassSpectrometry/QFeatures/issues |
全靠我 | msqrob2,scp,scpdata |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | QFeatures_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | QFeatures_1.4.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | QFeatures_1.4.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/QFeatures |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/QFeatures |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/QFeatures/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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