RNAmodR。AlkAnilineSeq

DOI:10.18129 / B9.bioc.RNAmodR.AlkAnilineSeq

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见RNAmodR。AlkAnilineSeq

AlkAnilineSeq检测m7G, m3C和D的修饰

Bioconductor版本:3.14

RNAmodR。AlkAnilineSeq从AlkAnilineSeq协议生成的实验数据中检测RNA上的m7G, m3C和D修饰。该包构建在RNAmodR包的核心功能之上,用于检测高通量测序数据中修改的特定模式。

作者:Felix G.M. Ernst [aut, cre],丹尼斯·拉方丹[ctb, nd]

维护者:Felix G.M. Ernst < Felix .gm。恩斯特在outlook.com>上写道

引文(从R内,输入引用(“RNAmodR.AlkAnilineSeq”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("RNAmodR.AlkAnilineSeq")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“RNAmodR.AlkAnilineSeq”)

超文本标记语言 R脚本 RNAmodR。AlkAnilineSeq
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 测序软件可视化WorkflowStep
版本 1.8.0
在Bioconductor BioC 3.10 (R-3.6)(2.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 4.0),RNAmodR(> = 1.5.3)更正
进口 方法,S4VectorsIRangesBiocGenericsGenomicRangesGviz
链接
建议 BiocStyleknitrrmarkdowntestthatrtracklayerBiostringsRNAmodR。数据
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/FelixErnst/RNAmodR.AlkAnilineSeq
BugReports https://github.com/FelixErnst/RNAmodR.AlkAnilineSeq/issues
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 RNAmodR.AlkAnilineSeq_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 RNAmodR.AlkAnilineSeq_1.8.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) RNAmodR.AlkAnilineSeq_1.8.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RNAmodR.AlkAnilineSeq
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/RNAmodR.AlkAnilineSeq
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/RNAmodR.AlkAnilineSeq/
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