研制

DOI:10.18129 / B9.bioc.RTN

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅研制。

研制:调节子的转录调控网络的重建和分析

Bioconductor版本:3.14

转录调控网络(环境)由一组转录因子(TFs)和监管目标基因。TFs监管者,识别特定DNA序列和指导基因组的表达,激活或抑制靶基因的表达。相同的一组基因控制的TF调节子。这个包提供了类和方法的重建环境和调节子的分析。

作者:克拉丽斯顶尖[所有],戈登•罗伯逊(施),新王(aut),迈克尔·弗莱彻(aut) Florian Markowetz (aut) Kerstin迈耶(aut)和毛罗·卡斯特罗(aut)

维护人员:毛罗·卡斯特罗< mauro.a。卡斯特罗在gmail.com >

安装

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如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“研制”)

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文档

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细节

biocViews	GeneExpression,GeneRegulation,GeneSetEnrichment,GeneticVariability,GraphAndNetwork,网络,NetworkEnrichment,NetworkInference,软件,转录
版本	2.18.0
Bioconductor自	BioC 2.13 (r - 3.0)(8.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(> = 3.6.3)方法
进口	红色的,minet,毒蛇,mixtools,雪统计数据,limma,data.table,IRanges,igraph,S4Vectors,SummarizedExperiment,车,压水式反应堆,pheatmap、grDevices图形,跑龙套
链接
建议	RUnit,BiocGenerics,BiocStyle,knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	http://dx.doi.org/10.1038/ncomms3464
取决于我	Fletcher2013b,RTNduals,RTNsurvival
进口我
建议我	geneplast
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	RTN_2.18.0.tar.gz
Windows二进制	RTN_2.18.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	RTN_2.18.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RTN
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/研制
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/RTN/
包下载报告	下载数据