此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见Rhtslib.
Bioconductor版本:3.14
这个包提供了1.7版的HTSlib C库,用于高通量序列分析。这个包主要对希望使用HTSlib的其他R包的开发人员有用。2021欧洲杯体育投注开户使用此包的动机和说明在小插图中,小插图(包=“Rhtslib”,“Rhtslib”)。
作者:Nathaniel Hayden [led, aut], Martin Morgan [aut], Bioconductor Package Maintainer [cre]
维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>
引文(从R内,输入引用(“Rhtslib”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“Rhtslib”)
超文本标记语言 | R脚本 | Rhtslib的动机和使用 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DataImport,测序,软件 |
版本 | 1.26.0 |
在Bioconductor | BioC 3.1 (R-3.2)(7年) |
许可证 | LGPL (>= 2) |
取决于 | |
进口 | zlibbioc |
链接 | zlibbioc |
建议 | knitr,rmarkdown,BiocStyle |
SystemRequirements | libbz2 & liblzma & libcurl(带头文件),GNU make |
增强了 | |
URL | //www.andersvercelli.com/packages/Rhtslibhttp://www.htslib.org/ |
BugReports | https://github.com/Bioconductor/Rhtslib/issues |
全靠我 | |
进口我 | deepSNV,diffHic,maftools,mitoClone2,scPipe |
建议我 | |
链接到我 | ArrayExpressHTS,bamsignals,BitSeq,csaw,deepSNV,DiffBind,diffHic,epialleleR,火焰,h5vc,maftools,methylKit,mitoClone2,podkat,qrqc,QuasR,Rfastp,Rsamtools,scPipe,seqbias,ShortRead,TransView,VariantAnnotation |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | Rhtslib_1.26.0.tar.gz |
Windows二进制 | Rhtslib_1.26.0.zip(32位和64位) |
macOS 10.13 (High Sierra) | Rhtslib_1.26.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Rhtslib |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/Rhtslib |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/Rhtslib/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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