Rhtslib

DOI:10.18129 / B9.bioc.Rhtslib

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见Rhtslib

HTSlib高通量测序库作为R包

Bioconductor版本:3.14

这个包提供了1.7版的HTSlib C库,用于高通量序列分析。这个包主要对希望使用HTSlib的其他R包的开发人员有用。2021欧洲杯体育投注开户使用此包的动机和说明在小插图中,小插图(包=“Rhtslib”,“Rhtslib”)。

作者:Nathaniel Hayden [led, aut], Martin Morgan [aut], Bioconductor Package Maintainer [cre]

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

引文(从R内,输入引用(“Rhtslib”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“Rhtslib”)

超文本标记语言 R脚本 Rhtslib的动机和使用
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataImport测序软件
版本 1.26.0
在Bioconductor BioC 3.1 (R-3.2)(7年)
许可证 LGPL (>= 2)
取决于
进口 zlibbioc
链接 zlibbioc
建议 knitrrmarkdownBiocStyle
SystemRequirements libbz2 & liblzma & libcurl(带头文件),GNU make
增强了
URL //www.andersvercelli.com/packages/Rhtslibhttp://www.htslib.org/
BugReports https://github.com/Bioconductor/Rhtslib/issues
全靠我
进口我 deepSNVdiffHicmaftoolsmitoClone2scPipe
建议我
链接到我 ArrayExpressHTSbamsignalsBitSeqcsawdeepSNVDiffBinddiffHicepialleleR火焰h5vcmaftoolsmethylKitmitoClone2podkatqrqcQuasRRfastpRsamtoolsscPipeseqbiasShortReadTransViewVariantAnnotation
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 Rhtslib_1.26.0.tar.gz
Windows二进制 Rhtslib_1.26.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra) Rhtslib_1.26.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Rhtslib
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/Rhtslib
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/Rhtslib/
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