SRGnet

DOI:10.18129 / B9.bioc.SRGnet

这个包是弃用。它可能会从Bioconductor删除。请参考包临终的指导方针为更多的信息。

这个包是Bioconductor的3.14版本。这个包已经从Bioconductor删除。最后稳定,最新的发布版本,请参阅SRGnet。

SRGnet: R包为研究从转录组数据协同响应基因突变

Bioconductor版本:3.14

我们开发了SRGnet分析协同监管机制在细胞转录组的概要文件,采取行动提高整体反应突变、药物或环境暴露。这个包可以用来识别管理模块协同响应基因的下游,优先考虑协同监管基因可能是潜在的干预目标,一些基因扰动实验。

作者:Isar Nassiri (aut (cre),马修·考尔(aut (cre)

维护人员:Isar Nassiri < isar_nassiri urmc.rochester.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“SRGnet”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	回归,软件,StatisticalMethod
版本	1.20.0
Bioconductor自	BioC 3.4 (r - 3.3)(5.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.3.1),EBcoexpress,质量,igraph,pvclust(2.0 > = 0),“绿带运动”(> = 2.1.1)limmaDMwR (> = 0.4.1),matrixStats,Hmisc
进口
链接
建议	knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SRGnet
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SRGnet
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/SRGnet/
包下载报告	下载数据